Dış Kaynaklı Proje Süreçleri Yönetim Sistemi
Er D. (Yürütücü), Dündar D. , Uzuner H.
Ekstraintestinal patojenik Escherichia coli (E. coli), dünya genelinde üriner sistem enfeksiyonlarında en sık karşılaşılan etkendir. Organizma, çok sayıda virülans faktörü taşımakla birlikte en önemli grup kolonizasyondan sorumlu olan adezinlerdir. Filogenetik analizlerle E. coli A, B1, B2 ve D gruplarına ayrılmıştır. Pandemik ve çoklu antibiyotik direncine sahip ST131 klonal grubu, B2 filogenetik grubuna aittir. Özellikle H30 ile H30-Rx olarak adlandırılan iki alt klonal grup, E. coli ST131 ile ilişkili enfeksiyonlardan sorumludur. Ülkemizde de ST131 klonal grubunu belirlemeye yönelik az sayıda çalışma bulunmakla birlikte, alt klonları hakkında bilgi bulunmamaktadır. Çalışmanın amacı, E. coli ST131 klonu ve H30 ile H30-Rx alt klonlarını belirlemektir. Toplam 250 hasta çalışmaya dahil edilmiştir. Hastaların yaş, cinsiyet, enfeksiyon kökeni, enfeksiyon yeri ve komplikasyon gibi bilgileri belirlenmiştir. İzole edilen üropatojenik E. coli kökenlerinde, çoklu PCR yöntemiyle filogenetik gruplar belirlenmiştir. B2 filogenetik grubunda bulunan izolatlar, E. coli ST131 klonal grubu için çeşitli PCR yöntemleriyle araştırılmıştır. Ayrıca, bu izolatlarda disk difüzyon testi kullanılarak anitibyogram yapılmıştır. ST131 olarak tanımlanan izolatlarda, H30 ve H30-Rx allelleri ve fimH, iha, papAH, sfa/focDE, afa/draBC, focG, gafD ve bmaE' yi kapsayan 8 adezin virülans geni araştırılmıştır. Virülans genlerinin sıklığı sırasıyla fimH, 39 (%100); iha 35 (%89,7); afa/draBC, 14 (%35,9); papAH, 10 (%25,6); sfa/focDE, 1 (%2,6); bmaE, 0 (%0); gafD, 0 (%0) ve focG, 0 (%0)' dır. Bu izolatların 34 (%87,2)' ü O25b, 5 (%12,8)' i O16 serotipine sahiptir. ST131-O25b izolatların hepsi H30 alt klonuna aittir. Toplam 34 ST131-O25b-H30 izolatın, 29 (%85,3)' u ise H30-Rx alt klonu olarak belirlenmiştir. ST131 izolatların 33 (%84,6)' ü çoklu ilaç direncine sahiptir. Virülans profillerinin, klonal grupların ve konak ile ilişkilerinin araştırılması, patojenezin anlaşılmasının temel basamaklarıdır. Bu sayede, E. coli ST131 gibi virülansı ve direnci yüksek organizmalara karşı anti-virülans yaklaşımların oluşturulması sağlanabilir.